O Instituto Oswaldo Cruz desempenha importante papel na formação de pesquisadores e recursos humanos na área das Ciências Biológicas e Biomédicas e de Educação em Saúde. Desenvolvendo pesquisa básica e novas tecnologias em seus 72 Laboratórios, constitui-se num dos principais centros nacionais de pesquisa e ensino nas mencionadas áreas.

A tradição de ensino no IOC começou com a especialização em nível de pós-graduação, quando foi criado por Oswaldo Cruz, em 1908, o "Curso de Aplicação de Manguinhos". Tal curso, inicialmente destinado a consolidar e a difundir a Bacteriologia como área de conhecimento e base para a investigação biomédica, evoluiu para os atuais programas de pós-graduação que têm formado recursos humanos em pesquisa para o próprio Instituto Oswaldo Cruz, para outras unidades da Fiocruz e para outras instituições do País e da América Latina.

Hoje, a maior participação do IOC, no Ensino, se realiza através dos seis Programas de Pós-graduação Stricto sensu do IOC titularam numerosos mestres e doutores, alcançando, em 2013, a marca de duas mil teses e dissertações defendidas. Atualmente, são oferecidos cursos de Mestrado e Doutorado em Biologia Parasitária, Medicina Tropical, Biologia Celular e Molecular, Ensino em Biociências e Saúde, Biologia Computacional e Sistemas e Biodiversidade e Saúde.